8月31日，中国科学院与国家自然基金委员会联合在京召开新闻发布会，正式宣告学术期刊《中国科学》和《自然科学进展》合并办刊。全国会副委员长、中国科学院院长、《中国科学》和《科学通报》理事会理事长路甬祥，中国科学院常务副院长白春礼，国家自然科学基金委员会主任陈宜瑜，全国教科文卫委副主任程津培，北京大学校长周其凤，浙江大学校长杨卫，《中国科学》和《科学通报》总主编和各辑主编等出席了新闻发布会。
《中国科学》和《科学通报》创刊于1950年，最初由中国科学院主管和主办；《自然科学进展》创刊于1990年，最初由国家自然科学基金委员会主管和主办。2002年，为了整合优势资源，中国科学院和国家基金委决定联合起来，对这三份刊物实行共同主办，以期通过三刊联合，增强力量，进一步将中国科技期刊推向世界，与国际接轨。
联合主办后，三刊刊载了大量具有创造性的、高水平的和有重要意义的最新研究成果的论文，为促进学术交流、推动科学技术的发展、扩大中国科学在国际的影响等方面做出了非常重要的贡献，在国内外科技界具有较高的影响力。
2008年，中国科学院和国家基金委提出了推进《中国科学》和《自然科学进展》之间的完全整合，以努力打造一个更加强大的综合性国家学术交流平台的重大决策。同年10月，中国科学院和国家自然科学基金委联合成立了合刊工作领导小组，积极推进各项合刊工作。对此，陈宜瑜曾在同年11月发表讲话说，将《中国科学》和《自然科学进展》完全合并，主要目的是进一步集中中国优秀的科技办刊资源，用更强的力量、更大的平台，帮助中国科学家走向世界，打造中国的国际大刊。
合刊后，为了更好地适应期刊国际化的要求，原《中国科学》系列杂志的英文版名称Science in China将改为Science China，体现其立足中国、面向世界的崭新姿态。《中国科学》的刊物定位，也进行了部分调整，在全面展示中国科学研究总体面貌、动态和成果的窗口，报道国内外重要科学进展，促进国内外学术交流的总体目标下，中文版还要肩负为华语科学界全面提供科学研究动态和研究成果信息，对国内的基础研究发挥借鉴和引导作用的责任。
